房贷抵扣个税夫妻双方不可以都扣1000，而是夫妻每个月的总扣除金额是1000元，具体按照申报后的比例进行扣除，即选择由一方按扣除标准100%扣除，或者是由夫妻双方分别申报按扣除标准的50%扣除。
如果夫妻双方只有一方达到纳税标准，即每月收入5000元，年度收入6万元，则只需要由一方申报100%扣除，另一方可以不用申报;但如果双方都达到纳税标准，建议选择收入高的一方进行扣除，另一方则可以申报其他的专项附加扣除项目。
房贷抵扣个税申报方法
1、通过扣缴义务人申报和综合所得年度自行申报。
2、选择通过扣缴义务人申报的话，那就是由单位负责申报，然后每个月发工资会进行代扣缴，如此一来，每个月都可以享受到住房贷款利息个税专项附加扣除。
个人所得税APP申报抵扣个税方法
1、下载并注册个人所得税APP。在手机上安装并注册个人所得税App，填写完整个人信息。
2、准备相关资料。准备房子的买卖合同和贷款合同等资料。
3、填写基本信息和房贷信息。在个人所得税App首页点击“住房贷款利息”，填写个人信息和房贷信息，包括贷款方式、贷款合同细节等。
4、填写配偶信息。如果有配偶，需填写配偶信息，并选择是否为共同借款人。
5、选择扣除比例和申报方式。可选择个人扣除或夫妻双方各扣50%，然后选择申报方式，可以通过扣缴义务人申报（单位代为扣缴申报）或综合年度所得自行申报。
6、提交信息。确认信息无误后提交。
