1、目的不同：廉租房解决城市中低经济收入家庭住房困难而建的普通住宅，有社会公共福利和住房社会保障性质。公租房是由政府政策支持，限定户型面积、供应对象和租金标准的公共租赁住房。
2、申请对象不同：廉租房的申请对象仅限于本市城镇低收入住房困难家庭，而公租房的申请对象不受区域和户籍限制，如本市中等偏下人群，新就业职工和外来务工人员。
3、收入限制标准不同：主城区申请廉租住房是当地民政部门认定的低收入家庭或最低收入家庭;申请公租房的收入、财产低于规定标准。另外，廉租房月租金标准约为0.8-1.2元/平方米。公租房的租金标准按照贷款利息、维护费等因素确定，不超过同类地段、同等品质房屋租金的60%，并动态调整。
公租房的申请流程
1、申请人应当根据市、县级人民政府住房保障主管部门的规定，提交申请材料，并对申请材料的真实性负责。申请人应当书面同意市、县级人民政府住房保障主管部门核实其申报信息。
2、申请人提交的申请材料齐全的，市、县级人民政府住房保障主管部门应当受理，并向申请人出具书面凭证。申请材料不齐全的，应当一次性书面告知申请人需要补全的材料。
3、对在开发区和园区集中建设面向用工单位或者园区就业人员配租的公共租赁住房，用人单位可以代表本单位职工申请。市、县级人民政府住房保障主管部门应当会同有关部门，对申请人提交的申请材料进行审核。
4、经审核，对符合申请条件的申请人，应当予以公示，经公示无异议或者异议不成立的，登记为公共租赁住房轮候对象，并向社会公开;对不符合申请条件的申请人，应当书面通知并说明理由。
5、申请人对审核结果有异议，可以向市、县级人民政府住房保障主管部门申请复核。市、县级人民政府住房保障主管部门应当会同有关部门进行复核，并在15个工作日内将复核结果书面告知申请人。
