公积金提前还款扣除利息其实是违约金。可能是客户未达到银行规定的提前还款要求就进行提前还款，从而银行就向客户收取了一定的违约金。房贷如果操作提前还款，一般提前还的是之后部分待还本金，没有利息。
像不少银行会规定客户需要按照合同约定的还款计划按时逐期偿还一年以上再申请提前还款，若不满一年就提前还款的话，就会收取提前还款金额百分之三到百分之五左右的违约金(具体以合同规定为准)。
而大家需要注意，房贷操作提前还款后，剩余未还部分会重新计算利息，然后客户可以选择保持还款期限不变，每月月供减少;当然，也可选择保持每月月供不变，还款期限减少。提前还款在一定程度上是可以减少房贷收取的利息的，客户要想减轻债务，就可以选择提前还款。
公积金提前还款需要注意什么?
1、还款顺序。如果同时有商业性和住房公积金贷款，应先还商贷再还公积金贷款，因为公积金贷款利率通常低于商业贷款利率。
2、还款时间。通常需要在还款满1年后才能提前还款，以避免缴纳违约金。
3、后续工作。提前还款结束后，需要到住房公积金管理中心办理退保手续，以避免出现其他手续费问题。
4、提前还款申请书。需要填写《住房公积金管理中心住房公积金贷款提前还清贷款申请书》或《住房公积金管理中心住房公积金贷款提前偿还部分贷款申请书》并签章和提供所需资料。
5、审批流程。需要经过受委托银行的审批和住房公积金管理中心的审批。
6、还款存档。提前还款成功后，需要将提前还款表交到住房公积金管理中心留档。
7、注意条件。申请人当前状态下没有逾期，且申请提前部分还贷的，每次还贷最低限额为一万元，且不得低于12个月的贷款本息额，每年限还贷一次。
